晓美焰为了拯救好友鹿目圆香，再一次回到之前的世界中。只是，重新开始的这个世界不再是她所认知的世界：在这个世界里，晓美焰和原作中的其他魔法少女遇到了许多她们没有见过的伙伴，而众人遇到的魔女也变的更加狰狞可怕，她们的战斗也变的异常的危险艰难。在危险而繁多的战斗中，众人逐渐被一个名叫乃木坂美琴的高中生魔法少女所感染，渐渐地以她为领袖，团结在一起，共同打击魔女。在不停的战斗中，晓美焰一直向众人揭穿QB的阴谋，可是包括乃木坂美琴在内的众人并不相信她的话。几经挫折的她决定，先在战斗中确保鹿目圆香的生存。结果，众魔法少女为自己过度的信任付出了极为沉重的代价：随着战斗的日益激烈，许多魔法少女在日趋白热化的战斗中阵亡，剩下的20几人艰难地在日益艰险的环境中挣扎着；终于，几位魔法少女在经历战友的牺牲、友伴的死亡、环境的险恶后，内心逐渐被负面情绪填满，而灵核也逐渐污浊起来——最终，在一次与巨大的魔女“麦莎”的战斗中完全黑化，蜕变成魔女。